Em abril de 2021, as atividades em 94% das escolas municipais paulistas foram prejudicadas pela pandemia. O resultado aparece em levantamento feito pelo Tribunal de Contas do Estado de São Paulo (TCE-SP). Das 644 prefeituras fiscalizadas pelo órgão, 529 (82%) decidiram interromper completamente as aulas in loco, 78 (12%) fizeram paralisação parcial e em apenas 37 (6%) não houve suspensão. Mesmo com as restrições, 516 municípios (80%) mantiveram a distribuição de merenda escolar.
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De acordo com levantamento, 574 cidades (89%) têm um plano de enfrentamento da covid-19 elaborado pelas secretarias municipais de Saúde, ou por órgão similar. Em 85% das cidades, a elaboração contou com o Conselho Municipal de Educação para auxiliar no planejamento das medidas adotadas, bem como para avaliar o impacto das restrições. Apenas a capital do Estado, São Paulo, não é monitorada pelo TCE-SP.